A direct detection of Escherichia coli genomic DNA using gold nanoprobes

Image via WikipediaBismillahirrohmanirrohiim. Tadi ada yang reques tentang jurnal nanobioteknologi. Dan alhamdulillah ada jurnal nanobioteknologi terbaru yang membahas cara deteksi langsung denom DNA E.Coli dengan menggunakan Nanoprobes Emas. Smoga bermanfaat. 

Deteksi Langsung genom DNA Escherichia coli dengan Menggunakan Nanoprobes Emas

Bakthavathsalam Padmavathy, Rajendran Vinoth Kumar dan Baquir Mohammed Jaffar Ali

Jurnal Nanobiotechnology 2012, 10:08 doi: 10.1186/1477-3155-10-8

Diterbitkan di: Februari 6, 2012

Abstrak (sementara)

Latar belakang

Dalam situasi seperti diagnosis sampel klinis dan forensik ada kebutuhan untuk sangat sensitif, metode DNA cepat dan spesifik deteksi. Meskipun amplifikasi DNA menggunakan PCR konvensional dapat memberikan hasil yang cepat, tidak banyak dilakukan di laboratorium diagnostik sebagian karena membutuhkan tenaga terampil dan peralatan yang mahal. Untuk mengatasi keterbatasan ini nanopartikel telah dieksplorasi sebagai sinyal probe untuk mendeteksi DNA ultrasensitif yang dapat digunakan dalam aplikasi lapangan. Di antara Nanomaterials, nanopartikel emas (AuNPs) telah banyak digunakan terutama karena properti optik dan kemampuan untuk mendapatkan difungsikan dengan berbagai biomolekul.

Hasil

Kami melaporkan sebuah protokol untuk penggunaan nanopartikel emas difungsikan dengan oligonukleotida beruntai tunggal sebagai probe pendeteksian visual (AuNP-oligo probe) untuk deteksi cepat dan spesifik dari Escherichia coli. Probe AuNP-oligo pada hibridisasi dengan sampel DNA target yang mengandung urutan komplementer tetap merah sedangkan sampel uji tanpa urutan DNA komplementer untuk probe ternyata ungu akibat asam diinduksi agregasi AuNP-oligo probe. Perubahan warna larutan tersebut diamati secara visual dengan mata telanjang menunjukkan deteksi langsung dan cepat dari Escherichia coli patogen dari DNA genomik tanpa kebutuhan untuk amplifikasi PCR. Batas deteksi adalah ~ 54 ng untuk DNA genomik unamplified. Metode ini membutuhkan waktu kurang dari 30 menit untuk menyelesaikan setelah ekstraksi DNA genom. Namun, dengan menggunakan DNA genom unamplified enzimatik dicerna, batas deteksi sebesar 11,4 ng tercapai. Hasil UV-Vis pengukuran spektroskopi dan pencitraan AFM lebih mendukung hipotesis agregasi berdasarkan diskriminasi visual. Untuk menjelaskan kegunaannya dalam medis diagnostik, uji ini divalidasi pada strain klinis Escherichia coli patogen yang diperoleh dari rumah sakit lokal dan sampel urin berduri. Ditemukan menjadi 100% sensitif dan terbukti sangat spesifik tanpa reaksi silang dengan non-strain Escherichia coli.

Kesimpulan

Karya ini memberikan masuk ke kelas baru DNA / emas nanopartikel bahan hibrida yang mungkin memiliki properti optik yang dapat dikontrol untuk aplikasi di diagnosa. Kami mencatat bahwa dimungkinkan untuk memperpanjang strategi ini mudah untuk mengembangkan jenis baru biosensor DNA untuk deteksi titik perawatan. Fitur yang menonjol dari pendekatan ini termasuk murah, reagen kuat dan deteksi kolorimetri sederhana patogen.

Artikel lengkap tersedia sebagai PDF.

Selain itu, berikut ini beberapa judul jurnal tentang nanobioteknologi :